直接标记和染色技术

Bionano 直接标记和染色 (DLS) 技术是一种新型无损化学方法，用于标记基因组 DNA 基序，可在各个方面改善 Bionano 基因组作图。

创新让一切更美好

在 DLS 技术出现前，需使用切口内切酶制造序列特异性切口来标记 DNA，这些切口由荧光标记，并在随后被修复。此过程具有高度稳定性及特异性，但是当切口位点在相对的链上且彼此靠近时，会引入系统性的双链断裂，从而限制 Bionano 基因组作图的连续性。

DLS 化学试剂能保持样本 DNA 的完整性，消除了系统性分子断裂。DLS 操作方案包括单独的酶标记反应，及随后的清洗和染色。该方法无需修复切口，因而是一种更简单的操作方案。

DLS 仅需花费传统方法的一小部分成本，即可提供最佳的基因组作图。

获得有史以来最长的分子——DLS 标记的分子可以非常长，经常可以看到＞2 Mbp 的天然分子。
染色体臂长图谱——DLS 基因组作图系统长度平均提高了 50 倍，改善了基因组结构的可视化程度，并创建了最连续和准确的组装。染色体臂和完整染色体通常组装在单个图谱中。

使用基于切口酶标记方法 (NLRS，顶部) 构建的图谱覆盖了整个人类 3 号染色体，用于进行全面的 SV 检测，但是高度碎片化。使用 DLS（底部），每个单倍体型每个染色体臂均仅被一个图谱覆盖。

始于 500 bp 的结构变异检测，DLS 提高了针对 500 bp 含插入和缺失的所有结构变异的检测灵敏度。
总成本为每（人类或人类大小）基因组 500 美元 —— DLS 使 Bionano 用户能以更经济的价格，更轻松地进行高通量作图。

Saphyr™ 用户现在即可购买 DLS 样本制备试剂盒。订购 DLS 制备试剂盒

DLS 用于结构变异检测

DLS 进一步提高了 Bionano 在结构变异检测和阐明复杂重排方面的业界领先的能力。通过为每个染色体臂的每个单倍型绘制单个图谱，复杂的重排可在单个连续图谱中显示出来。

DLS 将整个人类 10 号染色体组装成两个单一的图谱，由着丝粒分开（顶部）。基因位置显示为绿色。插入片段显示了多重大片段重排组装到单个图谱 10q11.21 区域，涉及到智力障碍/发育迟缓。

染色体臂长图谱意味着检测到的变异没有上限。DLS 大大增强了您在高灵敏度下对数百万碱基对 (Mbp) 变异事件检测的能力。另外，一种新的按标签拷贝数分析的算法可以使原始覆盖度分布归一化并提供对于拷贝数的推导，用于检测非整倍性、染色体臂缺失以及 500 kbp 以上的大片段插入和缺失。

两个品种的向日葵采用 DLS 映射，并从头组装成极长的图谱。鉴定出两个品种之间的大片段结构变异。

两个品种的向日葵采用 DLS 映射，并从头组装成极长的图谱。鉴定出两个品种之间的大片段结构变异。

染色体臂长图谱和新拷贝数 (CN) 测序为大规模 SV 检测及可视化提供了一种稳健的工具。此处显示了在白血病患者基因组中发现的一处 27 Mbp 的缺失。同样的缺失也在共有基因组图谱中被独立检测出（蓝色图谱与绿色参考图谱进行了比对）。与基因组作图比对的分子如下所示。

提高了针对所有 500 bp 以上突变检测的灵敏度

Bionano 算法可检测出所有主要结构变异 (SV)，灵敏度高达 99%，PPV 超过 98%。与使用从两种切口酶组装获得数据进行检测相比，使用单个 DSL 组装数据进行 SV 检测具有相同或更高的灵敏度。DLS 从 50 kbp 开始检测易位，而且对大片段插入的检测灵敏度比之前的方法更高。

DLE-1 是 DLS 家族的第一个酶，在人类基因组上有较高的标记密度，可以检测超过 500 bp 的插入和缺失。与检测下限为 1000 bp 的基于切口酶的方法相比，此检测范围代表了一种显著的改进。与 NGS 在人类基因组中检测的插入和缺失相比，Bionano SV 检测到的差异的中位数仅为 60 bp。

更高的产出更低的花费。

对于高通量用户，DLS 可将每个（人类或人类大小）基因组的成本降至 500 美元。以前，要获得最高的 SV 灵敏度，就需要两个独立的切口标记反应来绘制基因组图谱。现在仅需要一次 DLS 反应即可实现。

使用 DLS，您可以有效的将用于SV 检测的 Saphyr 通量提高一倍，这样每个 Saphyr 芯片在一次 24 小时运行中可以完成两次人类基因组图谱绘制